敦煌種業近年來在省市有關部門的大力支持下，堅持高起點、高科技、高效益的經營目標，不斷創新，開拓業務，增加投入，尋求突破，促進企業科技創新能力、開發能力，核心競爭力得到有效提升。根據省科技廳甘科高（2005）22號《關于認定甘肅省敦煌種業股份有限公司等五戶企業為區外高新技術企業的批復》和省經委甘經技（2005）266號《關于第八批省級企業技術中心考核認定結果的通知》，敦煌種業已于11月份被正式認定為省級高新技術企業，公司種子開發中心被批準為企業技術中心。
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