根據(jù)農業(yè)部農經發(fā)[2007]8號“農業(yè)部關于公布第三次監(jiān)測合格農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)名單的通知”，甘肅省敦煌種業(yè)股份有限公司繼2004年監(jiān)測合格、2005年被評為優(yōu)秀農業(yè)產業(yè)化經營國家重點龍頭企業(yè)后，2006年再次通過農業(yè)部組織的監(jiān)測，成為農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)合格單位。根據(jù)《農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)認定和運行監(jiān)測管理暫行辦法》，對農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)實行兩年一次的監(jiān)測評價制度，動態(tài)監(jiān)測合格的國家重點龍頭企業(yè)，將繼續(xù)享受有關優(yōu)惠政策。
      這次監(jiān)測是根據(jù)《農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)認定和運行監(jiān)測管理暫行辦法》的規(guī)定，在各省（自治區(qū)、直轄市）初步監(jiān)測的基礎上，經專家審核，全國農業(yè)產業(yè)化聯(lián)席會議審定，共有541家農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)監(jiān)測合格。
      敦煌種業(yè)是2003年經農業(yè)部等國家九部委審核批準為國家產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)的。近年來，公司圍繞做強做大主營業(yè)務，積極擴大產業(yè)規(guī)模、投資完善加工項目、合資合作、吸納整合優(yōu)勢資源、組建營銷網絡體系、加大科研開發(fā)等方式，促使經營形成種子、棉花、農產品加工三大優(yōu)勢產業(yè)，經營單位由上市前的11家發(fā)展到25家，其中種子企業(yè)13家，棉花企業(yè)7家，農產品加工企業(yè)4家，其它1家。公司目前共有員工1351人，其中大專以上510人，核心技術人員326人。 
      截止2006年底，敦煌種業(yè)實現(xiàn)主營業(yè)務收入8.94億元，比上年增加1.19億元，增長15.33％；實現(xiàn)凈利潤1301萬元。總資產達到16.97億元，資產負債率63%，每股收益0.07元。 目前，敦煌種業(yè)玉米、棉花、瓜菜種子的生產經營已穩(wěn)居西北地區(qū)第一位，瓜菜對外制種出口占全國同類種子出口量的10%，棉花購銷量占甘肅棉花總量的40%。公司現(xiàn)為農業(yè)部等九部委命名的優(yōu)秀農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)，國家工商局命名的全國守合同重信用企業(yè)，甘肅省認定的省級高新技術企業(yè)，公司綜合實力已進入中國種業(yè)最前列。  
      主要做法是：  
      1、健全機制建基地，穩(wěn)步擴大產業(yè)規(guī)模。公司堅持“公司聯(lián)基地，基地聯(lián)農戶”，公司根據(jù)不同作物種子生產的生態(tài)需要確定目標村，以村為單位根據(jù)不同品種、組合的要求，每年與村民委員會簽訂產銷合同千余份；各村根據(jù)農戶的具體情況和生產面積分戶簽訂產銷合同，每年簽訂量達10萬余份，農戶、基地、鄉(xiāng)村按合同生產，公司按合同收購銷售，把各方關系納入產業(yè)化利益共同體中。公司為基地農戶保證提供各類技術和物資服務，保證農戶的每畝收入不低于1300元；農戶保證制種面積產量符合要求，種子質量符合標準，以此為基本條款約束合同各方的經營行為。通過完善管理和建設，公司現(xiàn)已建成6大專業(yè)基地，其中以肅州區(qū)、金塔縣為中心區(qū)的瓜菜制種基地面積達到2萬畝；以肅州區(qū)為中心區(qū)的蕃茄制品原料生產基地面積達到2萬畝；以酒泉、張掖為中心區(qū)的玉米制種基地發(fā)展到20萬畝；以瓜州、金塔、敦煌為主的棉種及棉花基地發(fā)展到40萬畝，占本地棉花總面積的40%以上；以河南新鄉(xiāng)為中心的強筋小麥種子繁育面積達35萬畝；以武漢為中心的水稻油菜制種基地發(fā)展到2萬畝。  
      2、優(yōu)質服務聯(lián)農戶，提升企業(yè)帶動力。為了保證基地農戶的利益和公司利益，公司不斷總結完善了為農民提供的產前、前中、產后的系列化、全程化優(yōu)質服務。公司組織本企業(yè)950多名技術人員，管理100多個村的制種生產，常年吃住在村，指導到地塊，承包對基地的產前訂單落實、合同簽訂、親本提供、農膜、化肥供應，產中技術指導、生產管理、質量檢查，產后產品收購、銷售和資金結算；基地村與公司技術人員配合，負責承包對基地的管理、協(xié)調、面積落實，負責督促農戶承包制種生產過程中的田間作業(yè)管理、收獲和向公司交種等。在制種方面，公司每年拿出3500余萬元，向農戶墊付提供親本款、化肥、農藥、農膜款，代付水費等，畝均達200元以上，解決了農戶由于資金短缺造成的投入不足問題。在棉花產銷方面，公司通過棉花協(xié)會、二次結算方式把農民利益與企業(yè)聯(lián)在一起，解決了農民的后顧之憂。為了不斷提升服務水平和質量，公司在總結以往經驗的基礎上，從2006年起進一步規(guī)范完善了為農民提供的系列化、全程化優(yōu)質服務的內容和形式，把保產量、保質量作為保公司利益和提高農民收入的突破口來抓。進一步完善了產前訂單合同的內容，在基地內全面推行產量、質量目標管理責任制，全面加強和規(guī)范了產中技術指導、生產管理、質量檢查和產后產品收購、銷售和資金結算等工作，有效提高了基地管理的水平。通過以上措施為農戶提供服務，促使公司產業(yè)總體帶動能力達60萬畝，2006年通過訂單聯(lián)結農戶7.27萬戶，戶均從敦煌種業(yè)獲益1.048萬元。  
      3、增加投入抓開發(fā)，提高企業(yè)核心競爭力。公司把研發(fā)作為提升核心競爭力、培育新利潤增長點的突破口來抓，采取自主研發(fā)與合作開發(fā)結合，近年來先后從經營收入中拿出近1億元用于新產品開發(fā)和高新技術引進，年平均達3200萬元，已占企業(yè)年銷售總收入的5.8%。公司成立了新品種開發(fā)中心，開展了小麥、玉米、棉花、油料、瓜類、蔬菜、牧草、花卉等作物品種研發(fā)，研發(fā)出敦玉2號、敦玉518等一批新品種，選育的加工番茄品種Z00-73、鮮食番茄T-32已于2006年通過酒泉市科技局組織的技術鑒定，研究成果分別達到國內先進和省內先進水平。在國內率先以企業(yè)開展航天育種，目前優(yōu)良變異單株觀察篩選工作已進入第五代，已有部分苗頭材料出現(xiàn)。公司獨立研究完成的《噴霧干燥法生產大顆粒番茄粉技術開發(fā)》項目，經甘肅省科技廳鑒定，認定其技術達到國內同類技術先進水平。同時，公司充分利用內地科研院所人才、成果方面的優(yōu)勢，采取委托育種、合作育種、聯(lián)合開發(fā)、整體吸納、買斷產權品種、合資合作等形式加大了新品種創(chuàng)新力度，與十多家國內強勢玉米育種單位建立了科研協(xié)作關系；并考察新購了一批國家及省級審定玉米的新品種使用權。經過幾年努力，目前敦煌種業(yè)已擁有自主知識產權品種36個。  
    4、 抓網絡整合，營銷體系進一步健全。先后在鄭州、西安、成都三大營銷區(qū)域分別設立了辦事處，在黃淮海、東北、華北、西南、西北、長江流域建立了6個產品分銷區(qū)域網絡，擴大了自有知識產權品種的市場占有率。在棉花營銷網絡建設方面，成立了棉花營銷公司，充實了銷售隊伍，規(guī)范了營銷管理，把過去由各分公司通過棉麻公司銷售的方式改為由公司統(tǒng)一銷售，對產品資金進行統(tǒng)一管理。針對鐵路運力異常緊張的問題，公司設立了鐵路發(fā)運協(xié)調辦公室，加強了與鐵道部、蘭鐵局到各段站的協(xié)調溝通，發(fā)運產品達10余萬噸，為確保公司產品的適時發(fā)運創(chuàng)造了條件。  
      5、擴張兼并抓合作，拓寬經營領域。堅持通過項目帶動，市場化運作的路子，利用自有資金、募集資金和引進合資合作資金，圍繞主營產業(yè)發(fā)展和健全營銷網絡，采取資本運營手段，先后與國內一批企業(yè)、單位、研究院所達成協(xié)議，分別就占領資源市場、開發(fā)新產品、健全營銷網絡開展了一系列成功的兼并擴張業(yè)務，加快了項目建設。止2006年底，分別建成敦煌種業(yè)玉米種子加工中心等8個重點項目，其中種子加工廠1個、優(yōu)質棉花加工廠2個、投資組建控股子公司9家，使公司種子加工能力新增4.5萬噸、棉花加工能力增加3萬噸。2006年7月，公司與美國先鋒海外公司出資800萬美元，組建敦煌種業(yè)先鋒良種有限公司，項目總投資將達到2000萬美元。同時新增的以棉蛋白、油脂制品、蕃茄粉、蕃茄醬為主要產品的食品業(yè)務，年加工能力達6萬噸。  
      6、完善機構抓治理，不斷提高經營管理水平。公司建立了符合現(xiàn)代企業(yè)制度要求的“三會一層”治理結構，設有股東會、董事會、監(jiān)事會和經理層，現(xiàn)有發(fā)起人股東5個，社會公眾股東2.7萬個，董事11人、監(jiān)事7人、總經理等經營層高管人員7人。公司在管理方面實行總分公司管理體制，按照“一級法人，分級管理，授權經營，統(tǒng)一核算，自負盈虧”模式，對各分支機構的人、財、物和經營業(yè)務實行統(tǒng)一管理和授權經營。公司依照法定程序修訂和頒行了涉及公司重大決策、行權程序、授權經營、經營監(jiān)督、行政、財務、證券、人事、經營業(yè)務、投資項目等方面的60多項規(guī)章制度，“三會一層”均按股東大會議事規(guī)則、董事會議事規(guī)則、總經理議事規(guī)則和證監(jiān)會對上市公司關于法人治理結構的有關具體規(guī)定，明確了各位高管人員的職責范圍和責任，董事會成立有戰(zhàn)略策劃委員會和考評與薪酬委員會，制定了完整的考評與薪酬管理制度。目前，所有制度已在公司生產經營中得到有效執(zhí)行，公司整體決策嚴謹，行權規(guī)范，監(jiān)督有效，考核嚴格，績效掛鉤，為產業(yè)化經營提供了強有力的體制和機制保障。
    農業(yè)部指出：農業(yè)產業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)是引導農民發(fā)展現(xiàn)代農業(yè)的重要帶動力量，在推進一村一品、帶動農民增收、提高我國農業(yè)綜合生產能力和農產品國際競爭力等方面負有重要責任。要按黨中央、國務院積極發(fā)展現(xiàn)代農業(yè)，扎實推進社會主義新農村建設的要求，切實落實扶持農業(yè)產業(yè)化經營的各項政策，加強對龍頭企業(yè)的指導和服務。國家重點龍頭企業(yè)要繼續(xù)發(fā)揮資本、技術、信息和組織優(yōu)勢，進一步密切與農戶的利益聯(lián)結關系，加快技術創(chuàng)新，不斷提高市場競爭力和帶動農戶能力，采取村企聯(lián)動、村企對接等多種方式，積極參與社會主義新農村建設。